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單細胞測序技術服務 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 單細胞全轉錄組測序 |
生物分子凝聚體研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS |
NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
NGS测序技术服务 環狀DNA测序 |
基因芯片技術服務 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表觀轉錄組學測序服務 RNA m6A甲基化测序(MeRIP Seq) |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR(MazF酶切法)技术服务 |
Ribo-seq Ribo seq |
核糖體-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
蛋白表達定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
CNS新熱點:R-Loop 轉錄調控的主動參與者!
—— 全新推出DRIP-Seq,把握R-Loop研究的新方向!
R -loop是由轉錄的RNA链与打开的双链DNA其中一条链发生碱基互补配对,形成RNA-DNA杂合链,同时使未配对的另一条DNA鏈遊離在外組成的三方結構。R -loop分佈廣泛,占哺乳动物基因组的 5%,经常出现在基因组的启动子CGI和轉錄終止位點。已有研究表明,R -loop在調節基因表達、DNA 複製以及 DNA 和組蛋白修飾等方面均發揮着重要作用,具有重要的生物学功能。
Nat Genetics (IF 38.33): Antisense lncRNA通過形成R-loop影響coding RNA轉錄
Antisense lncRNA是與coding RNA轉錄方向相反,轉錄位置部分重合的長鏈非編碼RNA,通常可以顺式调控临近coding RNA的轉錄。2019年Nature Genetics發表的文章發現,antisense lncRNA TARID通過形成R-loop影響臨近coding RNA TCF21啓動子去甲基化,進而調控TCF21表達和癌症進程。
TCF21是與一種抑癌基因,在多种癌症中表达下调,它具有頭對頭反義lncRNA TARID(TCF21 antisense RNA inducing demethylation)。TARID轉錄過程會在TCF21启动子附近形成R-loop,被R-loop識別蛋白GADD45a結合,GADD45a進而招募去甲基化酶TET1,促進DNA去甲基化來增強TCF21轉錄,影響細胞週期。
Antisense lncRNA TARID通過形成R-loop調控TCF21啓動子DNA去甲基化及轉錄
DRIP-seq全新發布!
DRIP-seq(DNA:RNA hybrid immunoprecipitation and sequencing)利用特異性識別DNA:RNA雜合鏈的S9.6抗体对包含R-loop結構的 DNA 鏈進行富集,後續通過DNA測序來實現 R-loop分析,侧重于通过NGS在基因組水平上檢測R-loops結構的分佈,并通过生物信息学分析在不同的领域从中挖掘出更多有用的信息。
DRIP-seq優勢
嚴格的質控體系:設置陰性對照組和陽參,以控制文库质量。
穩定性高:實驗操作穩定性高,减少实验操作带来的误差。
靈活度高:能夠直接對有基因組信息的物種進行R-loop测序。
提供數據可視化,丰富的注释信息与文章发表级别的图谱