DFgueNOex
TdQPxwLqppr
PiYZNmAhbPqaFZHQUavxILAzNrbeWzLBjAIiGRWGnWlskaoPhwsVNFcVnu
jwEuOngD
YJXEYmbpBYjXTrV
QribSKU
單細胞測序技術服務 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 單細胞全轉錄組測序 |
生物分子凝聚體研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 RIME MS CoIP-MS |
NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
NGS测序技术服务 環狀DNA测序 |
基因芯片技術服務 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表觀轉錄組學測序服務 RNA m6A甲基化测序(MeRIP Seq) |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR(MazF酶切法)技术服务 |
Ribo-seq Ribo seq |
核糖體-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
蛋白表達定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6A RNA出现在多种重要的细胞生命过程中,意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程,如干细胞分化、生物节律等,同时也参与了多种疾病的发生,包括肿瘤、肥胖和不育等。
圖1:m6A甲基化和去甲基化示意图
目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)的方法,其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。
●靈活度高:能够直接对任意物种的转录组高甲基化片段进行测序,无需已知的基因组序列信息。
●檢測範圍廣:覆盖整个转录组范围的甲基化区域。
●精確度高:能够在实际结合位点100-200个碱基范围内精确定位。
●數字化信號:直接对甲基化片段进行定量和测序,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。
圖2:MeRIP-seq實驗流程圖
1.m6A甲基化峰分析
表1:m6A甲基化谱数据列表
2.m6A甲基化峰注释
利用RefSeq数据库对peak所在位置进行注释,统计不同转录本区域出现peaks的次数。
圖3:m6A甲基化峰分布图
3. m6A甲基化峰的可视化
m6A甲基化测序结果中的wig文件能够上传到基因组浏览器中,以便进行m6A信号区域的可视化。