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單細胞測序技術服務 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 單細胞全轉錄組測序 |
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生物分子凝聚體研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
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RNA-蛋白相互作用 HyPro - MS CHIRP – MS RNA pull-down MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 HyPro-seq/芯片 CHIRP-seq |
蛋白-RNA相互作用 AGO APP seq/芯片 RIP-RNA seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS |
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NGS测序技术服务 R-loop 测序分析服务 |
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NGS测序技术服务 環狀DNA测序 |
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基因芯片技術服務 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表觀轉錄組學測序服務 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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Ribo-seq Ribo seq |
核糖體-新生肽链复合物(RNC) RNC联合 circRNA芯片 RNC联合 lncRNA芯片 RNC联合mRNA-seq |
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蛋白表達定量 Label free非标定量技术 TMT标记定量技术 PRM靶向定量 |
近日，南方科技大学第一附属医院聂晓伟研究员团队与南方科技大学医学院药理学系卞劲松教授团队在国际心血管领域专业期刊Circulation Research杂志发表了题为“o8G site-specifically modified tRF-1-AspGTC: a novel therapeutic target and biomarker for pulmonary hypertension”的研究文章(IF=20.100)。
该文章利用Arraystar Human Small RNA Modification Microarray在低氧性肺動脈高壓（PH）患者肺组织中对带有o8G修饰的smallRNA进行筛选，找到了o8G修饰水平显著上调的tRF-1-AspGTC，O8G修饰发生在该tsRNA种子区第五位的G上。功能研究表明，抑制5o8G tRF-1-AspGTC降低了低氧诱导的肺动脉平滑肌细胞（PASMCs）增殖能力、逆转了细胞凋亡抵抗。靶基因预测发现，5o8G修饰允许5o8G tRF-1-AspGTC靶向WNT5A和CASP3的mRNA、抑制它们的表达，荧光素酶实验、AGO2 RIP實驗和RNA pull down實驗也驗證了兩者的結合關係；WNT5A及CASP3的表达下调通过BMPR2-ROS/5o8G tRF-1-AspGTC/WNT5信号通路直接导致了PASMCs增殖及凋亡抵抗，最终加剧了肺动脉高压的进展。该研究凸显了位置特异性的tRF o8G修饰在促进肺动脉高压发展中的作用，提供了一个具有前景的肺动脉高压治疗途径，并提示5o8G tRF-1-AspGTC作为一个潜在的创新性生物分子标志物来诊断该疾病。（其中smallRNA修饰芯片由给我免费播放片高清在线观看生物丨数谱生物提供）
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图注：A Arraystar smallRNA修饰芯片差异tsRNA聚类图；B o8G tRF-1-AspGTC靶基因预测韦恩图；C o8G tRF-1-AspGTC靶基因KEGG分析气泡图 |
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Arraystar Small RNA Modification Microarray
RNA pull down实验
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• 能够检测及定量多种small RNA上修饰：包括o8G，m7G，m6A，Ψ，m5C或m1A
• 能够检测多种small RNA：包括miRNA，pre-miRNA和tsRNAs（tRF＆tiRNA）
• 金标准准确定量small RNA的修饰: 直接RNA末端标记，避免了测序建库过程中因修饰导致的cDNA延伸中止的情况，可确保对small RNA修饰定量的高保真性。
• 高灵敏度检测低水平small RNA的修饰：克服二代测序的局限性，对低表达或低修饰水平的small RNA分析具有出色的分析灵敏度。
• 所需样品量少，总RNA量可低至2 µg。
