UdrzZmWmUeshrUGxHQgshzRPpKrXWZDZVxOnQPIurknOskxlyBxdyXdvJZtRGtXHGVdNiYvXubOGNNRewmpEwGKqaZwzmotnzmaZuExbVvZrncqQ
onoNPvVtDIxyJnnSXCbFev
jTEdSgpJNCiVKfWRrXGp
rqlxprPo
VwStpFqDEKHUEvTCGDecPvBaROvLewHYXIeLeqUIKCqViZdbBPhmLvjfpOHhXWoezZoyHFdnj|
單細胞測序技術服務 靶向lncRNA单细胞全转录组测序 單細胞全轉錄組測序 |
|
生物分子凝聚體研究 HyPro靶RNA临近标记技术 |
|
RNA-蛋白相互作用 CHIRP – MS RNA pull-down MS HyPro - MS |
RNA-RNA/DNA相互作用 CHIRP-seq HyPro-seq/芯片 |
蛋白-RNA相互作用 RIP seq/芯片 AGO APP seq/芯片 |
蛋白-蛋白相互作用 CoIP-MS/AP-MS |
|
DNA-蛋白相互作用 DNA pull down-MS |
|
NGS测序技术服务 DRIPc-seq |
|
NGS测序技术服务 環狀DNA测序 |
|
基因芯片技術服務 Small RNA修饰芯片 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 表觀轉錄組學測序服務 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 MeRIP-PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
|
NGS测序技术服务 DNA（羟）甲基化测序（抗体法） DNA甲酰基胞嘧啶(5fc)修饰测序 DNA 5hmC 测序（化学法） 染色質免疫共沉澱測序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
|
Ribo-seq |
核糖體-新身肽链复合物(RNC) |
|
蛋白表達定量 PRM靶向定量 TMT标记定量技术 非標定量技術 |
蛋白修飾定量 TMT标记定量乙酰化 TMT标记定量泛素化 Labelfree非标定量泛素化 Labelfree非标定量乙酰化 TMT标记定量磷酸化 非標定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 HyPro靶RNA临近标记技术 蛋白-蛋白相互作用 |
相關服務
Small RNA芯片相關產品
相關資源
外泌體之外結合AGO的smallRNA作为疾病诊断的biomarkerAGO APP smallRNA芯片服务利用特异性结合AGO1-4蛋白的T6B肽段偶联GST磁珠富集结合AGO蛋白的smallRNA，包括miRNA、tsRNA、Agotron、sdRNA等，进行smallRNA芯片筛选，从而获得结合AGO蛋白调控RNA稳定性和翻译的smallRNA。
Argonaute (AGO)蛋白是一类庞大的蛋白质家族，包含AGO1-4，是组成RISCs(RNA-induced silencing complex )复合物的主要成员[1]。AGO蛋白的经典功能是AGO2在细胞质中装载miRNA形成RISC复合物，并介导miRNA通过序列互补配对结合靶基因mRNA 3’UTR，促进mRNA降解或蛋白翻译抑制。AGO蛋白-smallRNA的复合物可以分泌到体液中并稳定存在，作为潜在的疾病诊断的生物标志物。
图1. 血浆外泌体之外结合AGO2稳定存在的miRNA[2]
u AGO APP可同时富集AGO1/2/3/4蛋白结合的smallRNA进行检测；
u AGO APP使用的T6B-coupled beads与Ago亲和性高，且检测物种更广泛（从昆虫到人都可检测）；
u AGO APP smallRNA芯片能检测miRNA、tsRNA、Agotron等多种smallRNA，覆盖范围广；
u 芯片探針檢測特異性高，操作簡單，样本需求量少。
參考文獻：
[1] Iwakawa HO, et al. Mol Cell. 2022. PMID: 34942118
[2] Arroyo, Jason D et al. PNAS. 2011. PMID: 21383194
實驗原理
AGO APP(Affinity Purification by Peptides) smallRNA芯片利用特异性结合AGO1-4蛋白的T6B-coupled GST beads富集结合AGO1-4的smallRNA[7]，包括miRNA、tsRNA、Agotron等，进行AGO APP smallRNA芯片筛选，从而获得结合AGO蛋白发挥调控功能的smallRNA（对于AGO结合的蛋白也可同时进行质谱检测）。
樣本用量：细胞用量>2*10^7个；组织>50mg；血浆血清>2ml。
實驗流程
1.細胞/组织裂解；
2.AGO APP富集结合的smallRNA；
3.SmallRNA 3’去磷酸化，DMSO变性，Cy3C标记；
4.與Arraystar smallRNA芯片杂交；
5.掃描芯片，进行数据分析；
6.提供結果報告。
1.差異AGO APP富集的smallRNA注释信息表格
2.差異AGO APP富集的smallRNA火山图、散点图、聚类图
3.深入數據分析：smallRNA 靶基因預測及靶基因GO/pathway分析
